软件开发不能解决企业的所有问题，软件定制开发引入也不可能符合所有企业的实际需要。成功实施软件定制开发，不仅与企业IT规划和实施策略有关，与软件定制开发实施团队整体素质有关，与软件定制开发选型和软件质量有关，与领导班子支持力度有关，与企业管理流程优化有关，与企业生产和管理基础有关，也与企业引入软件定制开发的时机或所处的发展阶段有关，与企业的承受能力有关。企业在引入软件定制开发前，既要理解软件开发的优势，也要充分估计到它可能带来的副作用。

软件定制开发的实施是一项复杂的工程，如何实施需要对企业内部的需求进行周密细致的研究论证，如可行性分析，论证技术经济上是否可行，明确要达到的具体目标。许多企业在进行软件定制开发的投资决策时，对自身的需求缺乏深入的研究，对与企业经营目标是否相适应的问题考虑不周。企业在实施软件定制开发项目时，要对项目规划和控制进行监督，有较强的风险意识，要充分考虑到实施过程中可能遇到的难题，从而降低成本，缩短实施周期。

选择好适合企业的软件定制开发软件供应商十分重要。现在的软件定制开发市场上软件开发非常多，因此选择一个适合企业特点和适应将来发展的软件开发就成为实施成功关键因素之一，它关系到整个项目实施的质量和进度，以及将来的扩展性。首先企业要明确自身的目的与需求，先做自我分析与诊断，然后要深入考察多家供应商及供应商服务的客户，必要时请管理咨询机构参与谋划和答别。建议企业在选择软件开发时，应根据几个因素来做出选择。一是软件开发对企业的适应性，这是选择时最重要的因素。二是成本效益问题。实施软件开发的总成本包括：软件开发的购买成本、配套的硬件设施、员工教育培训费、实施后的维护费。此外，还要考虑软件公司的性质；软件公司的开发能力；软件公司的服务体系和服务能力：软件产品的易用性；软件产品的扩展性；软件产品的升级性：软件产品的生命周期等等。软件定制开发的实施涉及到用户企业方与实施服务提供商两个企业，实施过程其实就是知识产品从实施服务提供商向用户企业转移的过程，也是双方相互认知的过程。要想降低交易成本企业必须对软件定制开发有充足的认识，从而信息就不会偏差太大，企业在与厂商的博弈中就不至处于劣势。